Hola, la mayoría de las casas rústicas tienen un común denominador: muros de piedra, techos de teja árabe o pizarra y el resto de la estructura de madera.
Mi primer consejo es que busques información sobre la zona. Cómo se está rehabilitando, qué normativa existe, qué colores y materiales han sido los típicos del lugar, hasta cuál es la configuración geográfica y qué vegetación es la autóctona.
Y después pasar a una segunda fase que es la de verter todos esos datos en el anteproyecto de tu vivienda, los cuales te servirán como punto de partida.
Verás que lo normal es rejuntar las piedras de los muros con un ¿mortero bastardo¿: de cal y cemento, coloreado. Y que lo aconsejable será desmontar la cubierta totalmente para aislarla en condiciones. La parte más complicada quizá sea la recuperación de la estructura de madera, si se quiere mantener la original habrá seguramente una lucha contra la carcoma que será difícil. Espero haberte ayudado, un saludo.